按结石的理化性质可分为磷酸盐、草酸盐、尿酸盐、胱氨酸、黄嘌呤盐5种，所占结石患者总数的比例依次为6%～9%、80%～84%、6%～10%、1%、1%以下。其中磷酸盐结石在碱性尿液中易于形成，草酸盐结石易在中性或酸性尿液中形成，后3者易在酸性尿液中形成。因此针对结石的性质，可选用药物来拮抗。

口服碳酸氢钠（小苏打）一日10g；或口服复方枸橼酸钠溶液（枸橼酸140g、枸橼酸钠98g、水加至1000ml）一日25～75ml，分3～4次服，以碱化尿液；每晚服乙酰唑胺（醋唑磺胺）0.25g，可维持夜间尿液碱化，可减少尿酸盐、胱氨酸、黄嘌呤盐结石的形成。 

口服维生素C一日1～2g，可酸化尿液，减少草酸盐、磷酸盐结石的形成；口服氢氯噻嗪一次50mg，一日2次，可减少尿钙的排泄；加口服维生素B6一日200mg，可减少尿液中草酸盐的排出；口服氧化镁一次100mg，一日3次，可防治复发性草酸钙结石；口服氢氧化铝凝胶一日30～60ml，可减少胃肠道对磷的吸收，从而预防磷酸盐结石形成；口服阿司匹林一日1000mg，以增加尿中磷酸钙的溶解度，预防磷酸钙结石复发。