PPI为前药，需在酸性环境中活化，同时60%～70%的质子泵活化出现在餐后，即质子泵最活跃之时，仅约5%出现在空腹时，最佳服药时间是餐前0.5小时即服。但奥美拉唑应在餐前1小时服用，因食物可减少奥美拉唑吸收达33%～50%。

　　①PPI血浆达峰时间短（30分钟），餐前0.5小时服用PPI的血浆药物浓度高，同时进餐刺激泵活化，使药物的峰浓度与活性泵数量大的时间平行。服用PPI时间过早，质子泵未被激活而药物已经大部消除；服用时间过晚，质子泵激活时而药物未被吸收，血浆药物浓度和作用强度均未达峰。 

　　②部分PPI（奥美拉唑、埃索美拉唑）有“酸突破现象”，即在夜间（晚22时～早6时）可出现超过1小时的胃内pH≤4.0，同时质子泵的再生时段主要在夜间，因此，睡前服用PPI抑酸效果不明显，若加用H2受体拮抗药（雷尼替丁150mg）可显著提高治疗效果。