甲状腺功能减退者主要以替代治疗为主。

　　⑴早期轻型病例：以口服甲状腺片或左甲状腺素（优甲乐）为主。左甲状腺素成人初始剂量每日50～100µg，随后每隔3～4周以50µg调整至适宜剂量，以保证稳定的正常新陈代谢，可能需要一日200～300µg或较大剂量。若增加新陈代谢的功能产生过速（导致腹泻、神经过敏、脉搏加快、失眠、震颤及在有潜伏性的心肌局部缺血情况时会心绞痛），应将剂量减低或停止1～2天，然后再从较低剂量初始。有冠心病或其他心血管疾病存在时，应用25µg为首次剂量较合适，隔4周后再每日增加25µg。儿童剂量为：6个月以下婴儿每日25～50µg；6～12个月婴儿每日50～75µg，1～5岁儿童每日75～100µg，6～12岁儿童每日100～150µg。 

　　⑵呆小症及幼年黏液性水肿：应用最大而又不致中毒的剂量（脉搏正常，无腹泻或便秘）。一般初始剂量为一日25µg，每2～4周增加25µg，直至出现轻度中毒症状，然后稍微减量维持治疗。幼年黏液性水肿症初始剂量为每日50～100µg，维持剂量第一年通常为每日100µg，之后幼年期升至300µg或较大剂量。空腹吸收最好，一般于早餐前服用。 

　　⑶严重慢性甲状腺缺乏症（黏液性水肿）：克汀病可选用碘塞罗宁（甲碘安），成人初始剂量一日20µg，以后渐增至每日80～100µg，分2～3次给药；儿童7kg以下，初始剂量为每日2.5µg；7kg以上为每日5µg，以后每隔1周，一日增加5µg；维持剂量为每日15～20µg，分2～3次给药。 

　　此外，尚可联合对症治疗，对中、晚期重型病例除口服甲状腺片或左甲状腺素外，需对症治疗如升压、给氧、输液、控制感染、控制心力衰竭等。 

有的甲减患者应从病因上积极治疗，若是因为药物所致的甲减，减量或停用后，甲减可以自行消失；若是下丘脑或垂体有大肿瘤，行肿瘤切除后，甲减有可能得到不同程度的改善；若是亚急性甲状腺炎引起的甲减，亚急性甲状腺炎治愈后，甲减也会消失；若是长期缺碘引起的甲减，需补充碘的摄入。